Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

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Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
KCNH2Q12809 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNH2Q12809 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNH2Q12809 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNH2Q12809 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
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