Protein–RNA interactions for Protein: Q12765

SCRN1, Secernin-1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN1Q12765 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SCRN1Q12765 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCRN1Q12765 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SCRN1Q12765 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCRN1Q12765 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
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