Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CCDC15Q0P6D6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CCDC15Q0P6D6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC15Q0P6D6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC15Q0P6D6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms