Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH3

ACSM2A, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM2AQ08AH3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM2AQ08AH3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM2AQ08AH3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM2AQ08AH3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms