Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PPARAQ07869 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PPARAQ07869 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PPARAQ07869 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PPARAQ07869 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms