Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABPB1Q06547 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABPB1Q06547 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABPB1Q06547 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GABPB1Q06547 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms