Protein–RNA interactions for Protein: Q06136

KDSR, 3-ketodihydrosphingosine reductase, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDSRQ06136 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KDSRQ06136 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KDSRQ06136 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KDSRQ06136 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KDSRQ06136 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms