Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NUCB1Q02818 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NUCB1Q02818 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NUCB1Q02818 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NUCB1Q02818 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
NUCB1Q02818 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms