Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRF8Q02556 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRF8Q02556 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IRF8Q02556 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IRF8Q02556 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms