Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MPP1Q00013 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MPP1Q00013 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MPP1Q00013 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MPP1Q00013 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.4 ms