Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
EFNB1P98172 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
EFNB1P98172 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EFNB1P98172 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms