Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELNP78509 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RELNP78509 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RELNP78509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RELNP78509 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RELNP78509 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RELNP78509 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RELNP78509 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RELNP78509 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELNP78509 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELNP78509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RELNP78509 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RELNP78509 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RELNP78509 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RELNP78509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RELNP78509 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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RELNP78509 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RELNP78509 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELNP78509 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RELNP78509 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RELNP78509 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RELNP78509 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELNP78509 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELNP78509 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELNP78509 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELNP78509 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RELNP78509 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RELNP78509 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELNP78509 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RELNP78509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELNP78509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RELNP78509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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