Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBXN2AP68543 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBXN2AP68543 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
UBXN2AP68543 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBXN2AP68543 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBXN2AP68543 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms