Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HERVK_113P63132 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERVK_113P63132 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P63132 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms