Protein–RNA interactions for Protein: P60891

PRPS1, Ribose-phosphate pyrophosphokinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPS1P60891 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRPS1P60891 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PRPS1P60891 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PRPS1P60891 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PRPS1P60891 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms