Protein–RNA interactions for Protein: P55072

VCP, Transitional endoplasmic reticulum ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPP55072 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPP55072 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPP55072 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VCPP55072 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPP55072 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPP55072 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPP55072 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPP55072 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
VCPP55072 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VCPP55072 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
VCPP55072 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPP55072 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPP55072 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPP55072 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPP55072 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
VCPP55072 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VCPP55072 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPP55072 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPP55072 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VCPP55072 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VCPP55072 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPP55072 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPP55072 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPP55072 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VCPP55072 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPP55072 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPP55072 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPP55072 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPP55072 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
VCPP55072 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPP55072 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPP55072 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
VCPP55072 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPP55072 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPP55072 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPP55072 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
VCPP55072 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
VCPP55072 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPP55072 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPP55072 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPP55072 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
VCPP55072 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
VCPP55072 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
VCPP55072 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPP55072 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPP55072 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPP55072 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPP55072 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
VCPP55072 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPP55072 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPP55072 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPP55072 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPP55072 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
VCPP55072 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
VCPP55072 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms