Protein–RNA interactions for Protein: P53618

COPB1, Coatomer subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB1P53618 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPB1P53618 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPB1P53618 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
COPB1P53618 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
COPB1P53618 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB1P53618 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB1P53618 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB1P53618 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB1P53618 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
COPB1P53618 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB1P53618 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB1P53618 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB1P53618 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
COPB1P53618 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB1P53618 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB1P53618 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB1P53618 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
COPB1P53618 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB1P53618 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
COPB1P53618 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB1P53618 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB1P53618 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
COPB1P53618 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
COPB1P53618 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB1P53618 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB1P53618 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB1P53618 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB1P53618 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
COPB1P53618 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
COPB1P53618 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB1P53618 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
COPB1P53618 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB1P53618 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB1P53618 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
COPB1P53618 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
COPB1P53618 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB1P53618 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB1P53618 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
COPB1P53618 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB1P53618 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB1P53618 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB1P53618 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
COPB1P53618 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
COPB1P53618 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
COPB1P53618 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
COPB1P53618 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB1P53618 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB1P53618 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB1P53618 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB1P53618 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
COPB1P53618 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB1P53618 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB1P53618 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB1P53618 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB1P53618 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
COPB1P53618 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB1P53618 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
COPB1P53618 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms