Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
CLCNKBP51801 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CLCNKBP51801 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CLCNKBP51801 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CLCNKBP51801 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms