Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
USP11P51784 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
USP11P51784 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
USP11P51784 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
USP11P51784 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP11P51784 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
USP11P51784 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
USP11P51784 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP11P51784 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP11P51784 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP11P51784 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
USP11P51784 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP11P51784 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
USP11P51784 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
USP11P51784 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP11P51784 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP11P51784 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP11P51784 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP11P51784 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
USP11P51784 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP11P51784 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP11P51784 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP11P51784 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP11P51784 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
USP11P51784 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
USP11P51784 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP11P51784 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP11P51784 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP11P51784 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
USP11P51784 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP11P51784 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP11P51784 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP11P51784 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
USP11P51784 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
USP11P51784 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
USP11P51784 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
USP11P51784 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP11P51784 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP11P51784 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP11P51784 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP11P51784 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
USP11P51784 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
USP11P51784 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
USP11P51784 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP11P51784 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
USP11P51784 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
USP11P51784 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP11P51784 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
USP11P51784 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
USP11P51784 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
USP11P51784 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
USP11P51784 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
USP11P51784 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
USP11P51784 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.9 ms