Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSEN2P49810 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSEN2P49810 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSEN2P49810 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSEN2P49810 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms