Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CENPAP49450 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPAP49450 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPAP49450 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CENPAP49450 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPAP49450 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPAP49450 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CENPAP49450 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CENPAP49450 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPAP49450 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPAP49450 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CENPAP49450 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CENPAP49450 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPAP49450 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPAP49450 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPAP49450 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPAP49450 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CENPAP49450 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CENPAP49450 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CENPAP49450 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CENPAP49450 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CENPAP49450 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CENPAP49450 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms