Protein–RNA interactions for Protein: P48775

TDO2, Tryptophan 2,3-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDO2P48775 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TDO2P48775 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TDO2P48775 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TDO2P48775 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TDO2P48775 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TDO2P48775 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TDO2P48775 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TDO2P48775 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TDO2P48775 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TDO2P48775 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TDO2P48775 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TDO2P48775 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TDO2P48775 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TDO2P48775 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TDO2P48775 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TDO2P48775 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TDO2P48775 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TDO2P48775 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TDO2P48775 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TDO2P48775 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TDO2P48775 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TDO2P48775 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TDO2P48775 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TDO2P48775 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TDO2P48775 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TDO2P48775 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TDO2P48775 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TDO2P48775 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TDO2P48775 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.23
TDO2P48775 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
TDO2P48775 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TDO2P48775 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
TDO2P48775 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TDO2P48775 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TDO2P48775 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TDO2P48775 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TDO2P48775 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TDO2P48775 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
TDO2P48775 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TDO2P48775 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TDO2P48775 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
TDO2P48775 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TDO2P48775 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TDO2P48775 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TDO2P48775 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TDO2P48775 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TDO2P48775 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
TDO2P48775 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TDO2P48775 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
TDO2P48775 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TDO2P48775 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TDO2P48775 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TDO2P48775 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms