Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL21P46778 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL21P46778 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RPL21P46778 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RPL21P46778 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL21P46778 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RPL21P46778 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL21P46778 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL21P46778 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL21P46778 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL21P46778 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
RPL21P46778 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RPL21P46778 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RPL21P46778 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RPL21P46778 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RPL21P46778 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL21P46778 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL21P46778 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL21P46778 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL21P46778 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RPL21P46778 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RPL21P46778 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RPL21P46778 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL21P46778 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL21P46778 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL21P46778 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RPL21P46778 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL21P46778 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL21P46778 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL21P46778 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL21P46778 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RPL21P46778 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL21P46778 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL21P46778 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL21P46778 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RPL21P46778 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RPL21P46778 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL21P46778 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL21P46778 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL21P46778 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL21P46778 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RPL21P46778 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL21P46778 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL21P46778 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL21P46778 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL21P46778 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RPL21P46778 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL21P46778 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL21P46778 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL21P46778 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RPL21P46778 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL21P46778 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL21P46778 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RPL21P46778 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms