Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC39.48■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC39.48■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.47■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.46■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
RANGAP1P46060 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.44■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC39.43■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.43■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC39.42■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC39.41■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.4■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.39■■■■□ 3.9
RANGAP1P46060 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC39.38■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC39.37■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC39.37■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC39.37■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC39.35■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC39.35■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC39.32■■■■□ 3.89
RANGAP1P46060 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC39.31■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.3■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.28■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC39.28■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC39.27■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.88
RANGAP1P46060 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.26■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC39.25■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.24■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
RANGAP1P46060 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms