Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DDIT3P35638 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DDIT3P35638 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DDIT3P35638 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DDIT3P35638 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms