Protein–RNA interactions for Protein: P34130

NTF4, Neurotrophin-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF4P34130 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NTF4P34130 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NTF4P34130 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
NTF4P34130 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NTF4P34130 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTF4P34130 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTF4P34130 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NTF4P34130 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NTF4P34130 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTF4P34130 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTF4P34130 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NTF4P34130 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NTF4P34130 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF4P34130 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF4P34130 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF4P34130 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF4P34130 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NTF4P34130 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTF4P34130 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NTF4P34130 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NTF4P34130 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NTF4P34130 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NTF4P34130 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTF4P34130 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTF4P34130 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
NTF4P34130 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NTF4P34130 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NTF4P34130 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTF4P34130 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NTF4P34130 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTF4P34130 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTF4P34130 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTF4P34130 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NTF4P34130 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms