Protein–RNA interactions for Protein: P32246

CCR1, C-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR1P32246 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCR1P32246 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCR1P32246 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCR1P32246 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCR1P32246 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCR1P32246 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCR1P32246 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCR1P32246 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR1P32246 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR1P32246 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCR1P32246 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR1P32246 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR1P32246 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR1P32246 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCR1P32246 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR1P32246 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR1P32246 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR1P32246 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCR1P32246 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CCR1P32246 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCR1P32246 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCR1P32246 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR1P32246 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR1P32246 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR1P32246 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR1P32246 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCR1P32246 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR1P32246 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR1P32246 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR1P32246 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR1P32246 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCR1P32246 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCR1P32246 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCR1P32246 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms