Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
CPS1P31327 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
CPS1P31327 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPS1P31327 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPS1P31327 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
CPS1P31327 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
CPS1P31327 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
CPS1P31327 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPS1P31327 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
CPS1P31327 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPS1P31327 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
CPS1P31327 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPS1P31327 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
CPS1P31327 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC35.22■■■■□ 3.23
CPS1P31327 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CPS1P31327 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
CPS1P31327 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPS1P31327 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPS1P31327 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
CPS1P31327 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.22
CPS1P31327 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.22
CPS1P31327 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
CPS1P31327 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
CPS1P31327 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPS1P31327 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPS1P31327 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPS1P31327 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
CPS1P31327 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
CPS1P31327 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CPS1P31327 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CPS1P31327 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
CPS1P31327 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
CPS1P31327 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
CPS1P31327 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
CPS1P31327 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPS1P31327 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPS1P31327 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
CPS1P31327 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
CPS1P31327 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CPS1P31327 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CPS1P31327 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
CPS1P31327 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CPS1P31327 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
CPS1P31327 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
CPS1P31327 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPS1P31327 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPS1P31327 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
CPS1P31327 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
CPS1P31327 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPS1P31327 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
CPS1P31327 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPS1P31327 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPS1P31327 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
CPS1P31327 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC35.02■■■■□ 3.2
CPS1P31327 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPS1P31327 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
CPS1P31327 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
CPS1P31327 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.19
CPS1P31327 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
CPS1P31327 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC35■■■■□ 3.19
CPS1P31327 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CPS1P31327 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
CPS1P31327 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CPS1P31327 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC34.98■■■■□ 3.19
CPS1P31327 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CPS1P31327 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPS1P31327 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CPS1P31327 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPS1P31327 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
CPS1P31327 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
CPS1P31327 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms