Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2E1P29083 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
GTF2E1P29083 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
GTF2E1P29083 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
GTF2E1P29083 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
GTF2E1P29083 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 978.6 ms