Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
LMO1P25800 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
LMO1P25800 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
LMO1P25800 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO1P25800 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO1P25800 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
LMO1P25800 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
LMO1P25800 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
LMO1P25800 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO1P25800 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO1P25800 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO1P25800 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
LMO1P25800 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO1P25800 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO1P25800 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
LMO1P25800 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LMO1P25800 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LMO1P25800 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO1P25800 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO1P25800 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO1P25800 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO1P25800 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO1P25800 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO1P25800 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO1P25800 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO1P25800 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO1P25800 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO1P25800 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO1P25800 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO1P25800 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO1P25800 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms