Protein–RNA interactions for Protein: P22455

FGFR4, Fibroblast growth factor receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR4P22455 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FGFR4P22455 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FGFR4P22455 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FGFR4P22455 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGFR4P22455 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGFR4P22455 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms