Protein–RNA interactions for Protein: P21283

ATP6V1C1, V-type proton ATPase subunit C 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1C1P21283 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATP6V1C1P21283 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ATP6V1C1P21283 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATP6V1C1P21283 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP6V1C1P21283 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms