Protein–RNA interactions for Protein: P18505

GABRB1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB1P18505 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GABRB1P18505 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GABRB1P18505 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
GABRB1P18505 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GABRB1P18505 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms