Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CTPS1P17812 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CTPS1P17812 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTPS1P17812 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CTPS1P17812 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms