Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NAGAP17050 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NAGAP17050 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NAGAP17050 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NAGAP17050 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGAP17050 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGAP17050 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGAP17050 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NAGAP17050 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGAP17050 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGAP17050 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NAGAP17050 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NAGAP17050 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NAGAP17050 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NAGAP17050 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGAP17050 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGAP17050 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
NAGAP17050 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NAGAP17050 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGAP17050 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGAP17050 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGAP17050 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGAP17050 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NAGAP17050 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAGAP17050 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAGAP17050 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAGAP17050 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAGAP17050 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NAGAP17050 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NAGAP17050 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NAGAP17050 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.1 ms