Protein–RNA interactions for Protein: P15509

CSF2RA, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RAP15509 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CSF2RAP15509 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CSF2RAP15509 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CSF2RAP15509 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF2RAP15509 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF2RAP15509 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CSF2RAP15509 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF2RAP15509 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CSF2RAP15509 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms