Protein–RNA interactions for Protein: P15336

ATF2, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-2, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF2P15336 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF2P15336 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF2P15336 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF2P15336 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF2P15336 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF2P15336 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF2P15336 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF2P15336 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF2P15336 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF2P15336 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF2P15336 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF2P15336 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATF2P15336 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF2P15336 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF2P15336 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATF2P15336 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF2P15336 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF2P15336 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF2P15336 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ATF2P15336 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF2P15336 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF2P15336 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
ATF2P15336 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATF2P15336 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF2P15336 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF2P15336 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF2P15336 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATF2P15336 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF2P15336 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF2P15336 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF2P15336 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATF2P15336 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ATF2P15336 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATF2P15336 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF2P15336 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF2P15336 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF2P15336 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF2P15336 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ATF2P15336 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF2P15336 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF2P15336 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
ATF2P15336 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF2P15336 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF2P15336 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF2P15336 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF2P15336 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ATF2P15336 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATF2P15336 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF2P15336 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF2P15336 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF2P15336 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF2P15336 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATF2P15336 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF2P15336 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF2P15336 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF2P15336 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF2P15336 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATF2P15336 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATF2P15336 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms