Protein–RNA interactions for Protein: P12645

BMP3, Bone morphogenetic protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP3P12645 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
BMP3P12645 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BMP3P12645 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
BMP3P12645 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
BMP3P12645 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BMP3P12645 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
BMP3P12645 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BMP3P12645 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
BMP3P12645 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
BMP3P12645 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
BMP3P12645 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
BMP3P12645 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BMP3P12645 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BMP3P12645 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
BMP3P12645 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
BMP3P12645 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
BMP3P12645 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
BMP3P12645 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
BMP3P12645 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
BMP3P12645 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BMP3P12645 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BMP3P12645 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
BMP3P12645 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
BMP3P12645 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
BMP3P12645 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BMP3P12645 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BMP3P12645 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
BMP3P12645 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
BMP3P12645 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BMP3P12645 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
BMP3P12645 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BMP3P12645 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
BMP3P12645 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BMP3P12645 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
BMP3P12645 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP3P12645 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP3P12645 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP3P12645 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
BMP3P12645 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP3P12645 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP3P12645 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP3P12645 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
BMP3P12645 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BMP3P12645 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
BMP3P12645 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
BMP3P12645 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BMP3P12645 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BMP3P12645 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BMP3P12645 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP3P12645 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP3P12645 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP3P12645 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP3P12645 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
BMP3P12645 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
BMP3P12645 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BMP3P12645 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BMP3P12645 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BMP3P12645 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
BMP3P12645 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
BMP3P12645 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BMP3P12645 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms