Protein–RNA interactions for Protein: P11940

PABPC1, Polyadenylate-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1P11940 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PABPC1P11940 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PABPC1P11940 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PABPC1P11940 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PABPC1P11940 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms