Protein–RNA interactions for Protein: P11279

LAMP1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMP1P11279 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LAMP1P11279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LAMP1P11279 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LAMP1P11279 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LAMP1P11279 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms