Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ITGAMP11215 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ITGAMP11215 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ITGAMP11215 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ITGAMP11215 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms