Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 AC124312.2-201ENST00000546615 427 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ATXN8OSP0DMR3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATXN8OSP0DMR3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ATXN8OSP0DMR3 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms