Protein–RNA interactions for Protein: P0DJ93

SMIM13, Small integral membrane protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM13P0DJ93 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMIM13P0DJ93 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMIM13P0DJ93 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SMIM13P0DJ93 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms