Protein–RNA interactions for Protein: P0C843

LINC00032, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00032, humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00032P0C843 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LINC00032P0C843 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
LINC00032P0C843 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LINC00032P0C843 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.9 ms