Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC172P0C7W6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CCDC172P0C7W6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CCDC172P0C7W6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CCDC172P0C7W6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.8 ms