Protein–RNA interactions for Protein: P0C7H9

USP17L7, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L7P0C7H9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
USP17L7P0C7H9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
USP17L7P0C7H9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
USP17L7P0C7H9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms