Protein–RNA interactions for Protein: P05026

ATP1B1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1B1P05026 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ATP1B1P05026 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATP1B1P05026 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ATP1B1P05026 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ATP1B1P05026 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms