Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PRB1P04280 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRB1P04280 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PRB1P04280 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB1P04280 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB1P04280 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRB1P04280 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB1P04280 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB1P04280 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB1P04280 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRB1P04280 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PRB1P04280 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB1P04280 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB1P04280 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB1P04280 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB1P04280 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRB1P04280 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB1P04280 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB1P04280 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB1P04280 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRB1P04280 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRB1P04280 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRB1P04280 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRB1P04280 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRB1P04280 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PRB1P04280 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRB1P04280 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PRB1P04280 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRB1P04280 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRB1P04280 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRB1P04280 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PRB1P04280 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRB1P04280 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRB1P04280 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRB1P04280 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRB1P04280 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRB1P04280 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRB1P04280 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRB1P04280 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRB1P04280 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRB1P04280 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRB1P04280 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB1P04280 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB1P04280 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB1P04280 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRB1P04280 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PRB1P04280 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms