Protein–RNA interactions for Protein: P01717

IGLV3-25, Immunoglobulin lambda variable 3-25, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGLV3-25P01717 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
IGLV3-25P01717 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
IGLV3-25P01717 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
IGLV3-25P01717 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
IGLV3-25P01717 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms