Protein–RNA interactions for Protein: P00966

ASS1, Argininosuccinate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASS1P00966 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ASS1P00966 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ASS1P00966 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASS1P00966 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASS1P00966 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASS1P00966 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASS1P00966 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ASS1P00966 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASS1P00966 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASS1P00966 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASS1P00966 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASS1P00966 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ASS1P00966 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ASS1P00966 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASS1P00966 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASS1P00966 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ASS1P00966 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASS1P00966 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASS1P00966 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
ASS1P00966 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ASS1P00966 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ASS1P00966 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASS1P00966 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASS1P00966 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ASS1P00966 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASS1P00966 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASS1P00966 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASS1P00966 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASS1P00966 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ASS1P00966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASS1P00966 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASS1P00966 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
ASS1P00966 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASS1P00966 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ASS1P00966 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASS1P00966 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ASS1P00966 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ASS1P00966 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASS1P00966 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASS1P00966 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASS1P00966 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASS1P00966 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ASS1P00966 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASS1P00966 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASS1P00966 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ASS1P00966 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ASS1P00966 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASS1P00966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ASS1P00966 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ASS1P00966 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ASS1P00966 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ASS1P00966 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASS1P00966 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASS1P00966 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASS1P00966 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ASS1P00966 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASS1P00966 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASS1P00966 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASS1P00966 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASS1P00966 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ASS1P00966 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ASS1P00966 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ASS1P00966 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms